STR鑒定
細胞系錯誤鑒定問題已有50年歷史,基于國際細胞庫的分析數(shù)據(jù)顯示:1984年細胞錯誤鑒定率為35%,1999年為18%,直到最近幾年,應用于生物醫(yī)學領域的細胞系需要鑒定的問題仍然很少有人關注。咨詢電話:13816144967(微信同號)
STR(Short Tandem Repeat,短串聯(lián)重復序列)是一類廣泛存在于真核生物基因組中的DNA串聯(lián)重復序列,其核心序列重復次數(shù)存在個體差異多態(tài)性,因此STR也被稱為細胞的DNA指紋。
近年來,大量研究表明STR基因分型方法是進行細胞交叉污染和性質鑒定的最有效和準確的方法之一,STR基因分型應用于細胞鑒定已被ATCC等機構強烈推薦。美國的ATCC細胞庫、德國的DSMZ細胞庫以及日本的JCRB細胞庫等為STR分型提供了各細胞株的數(shù)據(jù)供比對。越來越多的雜志在投稿時要求撰稿人提供細胞STR分析數(shù)據(jù),STR已被ATCC等機構作為細胞鑒定的金標準。
鑒定方法:
STR基因位點由長度為3~7個堿基對的短串連重復序列組成,可通過PCR(聚合酶鏈式反應)來檢測。STR基因座位上的等位基因可通過擴增區(qū)域內重復序列的拷貝數(shù)的不同來區(qū)分,在毛細管電泳分離之后可通過熒光檢測來識別。隨后通過一定的計算方法,即可根據(jù)所得的STR分型結果與專業(yè)的細胞STR數(shù)據(jù)庫比對從而推算出樣品所屬的細胞系或可能的交叉污染的細胞系名稱。咨詢電話:13816144967(微信同號)
什么時候需要細胞系STR鑒定?
? 發(fā)表文章或申請課題經費前;
? 使用細胞進行臨床治療(試驗)前;
? 準備凍存保種或已凍存多年的細胞;
? 一個涉及到細胞試驗項目開始/結束時;
? 新得到的細胞或實驗室培養(yǎng)5代以上的細胞;
? 細胞系表現(xiàn)不穩(wěn)定或結果與預期差別較大;
? 異體細胞移植后嵌合情況檢查。
這樣將避免由于細胞系交叉污染或身份誤認,導致的金錢、時間的浪費和無效實驗數(shù)據(jù)的產生。
樣品要求:
活細胞:T25培養(yǎng)瓶,60%-70%密度,細胞數(shù)>106個,寄出前灌滿培養(yǎng)基封口膜密封蓋子,常溫運輸。
細胞沉淀/凍存細胞:細胞數(shù)量需≥106,干冰運輸。
DNA樣本:OD260/OD280=1.8~2.0,DNA濃度≥50ng/uL,DNA體積≥20uL。咨詢電話:13816144967(微信同號)